Wakolda representará a la Argentina en los premios Goya. La película fue elegida por la Academia de Artes y Ciencias Cinematográficas de la Argentina para competir en la categoría de mejor película iberoamericana de los premios Goya.
En la votación, que se realizó sobre las películas que fueron estrenadas entre el 1 de noviembre de 2012 y el 31 de octubre de 2013, la historia dirigida por Lucía Puenzo que narra la relación entre el nazi Josef Mengele y una familia argentina, se impuso frente a Tesis sobre un homicidio, de Hernán Goldfrid, con el 50.65% (la protagonizada por Ricardo Darín obtuvo el 29.87%).
En tercer lugar quedó Metegol, de Juan José Campanella y luego Corazón de León, de Marcos Carneval, y La Reconstrucción, de Juan Taratuto.
Wakolda también está prenominada para el Oscar.